O Instituto Doutor José Frota tem a missão de promover assistência de excelência a pessoas em situação de urgência e emergência, com foco no trauma e na alta complexidade, sendo instituição de ensino, pesquisa e orientadora de políticas públicas em saúde.
É reconhecido pela sociedade como um complexo hospitalar terciário de excelência com foco no trauma e no desenvolvimento do ensino e pesquisa.