A Coordenadoria do Terceiro Setor e Instituições Religiosas apoia-se na construção de políticas públicas e sociais, visando o favorecimento da liberdade de expressão, sobretudo o exercício da liberdade religiosa amparada pela legislação em vigor. Tem como objetivo atender as demandas das instituições religiosas na Prefeitura de Fortaleza, seja coordenando, articulando, orientando ou auxiliando, viabilizando, assim, diversas solicitações, tais como: requerimentos para execução de projetos sociais em geral, documentações necessárias para a realização de eventos, colaboração nas ações sociais das entidades religiosas, de modo que suas atividades tenham livre funcionamento dentro das comunidades, como nos espaços públicos, em harmonia com o município.
Desta forma, ela foi criada para aprimorar o diálogo entre as entidades religiosas e os órgãos competentes, visando a realização de eventos religiosos no município, que serão desenvolvidos no âmbito da coordenadoria do município de Fortaleza, por meio das instituições religiosas.